Bora Bora leży w strefie łagodnego klimatu zwrotnikowego. Od czerwca do października powietrze jest bardziej suche a temperatury niższe i nie tak uciążliwe. Od lipca do sierpnia zdarzają się wiatry „maraamu” przynoszące zmienną pogodę. Okres między listopadem i majem to pora deszczowa – cieplejsza, z większą ilością przelotnych opadów. Sezon nurkowy trwa tutaj praktycznie cały rok. Zmienność pogody na lądzie nie ma wpływu na podwodne życie.